Нестеровский район расположен на восточной окраине Калининградской области в пределах Виштынецкой возвышенности.
Здесь находятся объекты, призванные памятниками природы: озеро Виштынецкое, природный парк «Виштынецкий», река Красная. Виштынецкую возвышенность по праву называют озерным краем. Около двух третей всей поверхности водных зеркал области находится здесь, именно здесь существуют самые большие и глубокие озера Калининградской области.
Виштынецкая возвышенность (лит. Sūduvos aukštuma, Судувская возвышенность; польск. Pojezierze Suwalskie) — холмисто-моренная возвышенность, занимающая крайний юго-восток Калининградской области России и далее уходящая на территорию Польши и Литвы (здесь расположен тройной стык). Расположена у северного склона Балтийской моренной гряды. Расчленена долинами притоков рек Анграпа и Писса (речки Красная, Русская, Глубокая и др.)
Виштынецкая возвышенность представляет собой самый высокий участок территории Калининградской области с высотами, превышающими 200 метров выше уровня моря (при средней по области 15 м). Гора Дозор (230,9 кв.м. – является высшей точкой области. При этом за пределами России (приблизительно в 10 км к юго-востоку) высота возвышенности достигает своего пика в 309 м (гора Зеескер).